税務調査はいつ来るのか？時期・頻度・対象と対策を徹底解説

この記事は、法人経営者や個人事業主、相続を経験した方、さらにはサラリーマンなど、税務調査がいつ来るのか？気になるすべての方に向けて経験豊富な税理士の北村嘉章税理士（北村税理士事務所)が詳しく解説しています。

税務調査が「いつ来るのか」「どんな準備が必要か」「どんな流れで進むのか」といった、よくある疑問や不安を解消するための基礎知識と最新情報を、わかりやすく解説します 。

この記事を読むことで、税務調査がいつ来るのかの不安を減らし、安心して日々の業務や生活に取り組めるようになるでしょう。

税務調査について基本知識を理解しよう

税務調査の概要と目的

税務調査とは、税務署や国税局が納税者の申告内容に誤りや不正がないかを確認するために行う調査です。主な目的は、正しい税金が納められているかをチェックし、税収の公平性を保つことにあります。

調査は、法人や個人事業主だけでなく、相続や贈与を受けた方、場合によってはサラリーマンにも及ぶことがあります。

調査の結果、申告漏れや不正が発覚した場合は、追徴課税や加算税が課されることもあるため、正確な申告と日頃の記帳が重要です。

税務調査の種類は大きく分けて任意調査と強制調査がある

任意調査は、税務署から事前に連絡があり、納税者の協力のもとで行われる一般的な調査です。

一方、強制調査は、重大な脱税の疑いがある場合に裁判所の令状を得て行われ、納税者の同意がなくても帳簿や資料の押収が可能です。

調査の種類	特徴
任意調査	税務署から事前に連絡があり、納税者の協力のもとで行われる一般的な調査
強制調査	重大な脱税の疑いがある場合に裁判所の令状を得て行われ、納税者の同意がなくても帳簿や資料の押収が可能な調査

多くの方が経験するのは任意調査であり、強制調査はごく一部の悪質なケースに限られます。

なぜ税務調査が行われるのか？

税務調査が行われる主な理由は、申告内容に不自然な点や不備が見られる場合 、過去の調査で指摘があった場合 、特定の業種や取引にリスクがあると判断された場合などです 。

その他にも、相続や贈与など大きな資産移動があった際 や、匿名の通報・情報提供があった場合 にも調査対象となることがあります。

税務署は、申告書の内容や業種ごとの平均値、過去のデータなどをもとに調査対象を選定しているため、日頃から正確な記帳と適切な申告を心がけることが、税務調査のリスク低減につながります 。

以下は主な税務調査の選定理由です。

• 申告内容の不備や不自然な点
• 過去の調査での指摘
• 特定業種や高リスク取引
• 相続・贈与など大きな資産移動
• 匿名の通報や情報提供

税務調査はいつ来るのか？

税務調査の通知時期と予兆

税務調査がいつ来るのかは明確な決まりがありません 。しかし、以下の時期に調査が本格化したり、増える傾向があります 。

• 4～5月: 個人事業主の確定申告が終わる時期にも調査が増える 。
• 7月以降: 税務署や国税局の人事異動が終わる7月以降から新年度の調査が本格化する 。
• 9月～11月: 秋の時期に現場調査が多く行われる傾向がある 。

事前通知が基本であり、突然の訪問は稀です 。調査の予兆としては、税務署からの電話や書面による連絡、追加資料の提出依頼などが挙げられます 。

法人および個人事業主の税務調査頻度

法人や個人事業主が税務調査を受ける頻度は、業種や規模、過去の申告状況によって異なります。

一般的には、法人の場合は3年から5年に一度、個人事業主の場合は5年から10年に一度程度が目安とされていますが売上規模が大きい、現金商売が多い、過去に指摘があった場合などは、調査頻度が高くなる傾向があります。

一方で、適切な申告と記帳を続けている場合は、調査の間隔が長くなることもあります。

対象	調査頻度の目安
法人	3～5年に一度
個人事業主	5～10年に一度

10年以上来ないケースの理由

税務調査が10年以上来ないケースも珍しくありません。その理由としては、売上規模が小さい、業種的にリスクが低い、過去の調査で問題がなかった、適切な申告と記帳が継続されているなどが挙げられます。

また、税務署の人員や調査リソースの都合で、全ての事業者を頻繁に調査することが難しい現状も影響しています。

税務調査の対象となるケースとリスク

相続による税務調査の注意点

相続税の申告後、1～2年以内に税務調査が行われるケースが多い傾向にあります。特に、申告内容に不自然な点がある場合や、財産の評価額が大きく異なる場合は調査対象となりやすいです。

また、相続税の申告期限から5年以内であれば調査が行われる可能性があるため、相続財産の把握や適切な評価、証拠書類の保管が重要です。

相続人同士のトラブルや、名義預金・海外資産の有無も調査のポイントとなります。相続税の調査は専門的な知識が必要なため、税理士などの専門家に相談することをおすすめします。

特定業種における税務調査のリスク

現金取引が多い飲食業や小売業、建設業、医療・美容業などは、税務調査のリスクが高いとされています。

これらの業種は売上や経費のごまかしが発生しやすいと見なされるため、税務署も重点的に調査を行う傾向があります。また、急激な売上増減や、業界平均と大きく異なる利益率も調査のきっかけとなります。

業種	調査リスク
飲食業	高い（現金管理、売上除外に注意）
小売業	高い（現金管理、棚卸資産に注意）
建設業	高い（外注費、架空経費に注意）
医療・美容業	高い（自由診療の売上、経費計上 に注意）

サラリーマン（会社員）の税務調査確率

会社員であるサラリーマンが税務調査の対象となる確率は非常に低いですが、副業収入や不動産収入、株式譲渡益などがある場合は注意が必要です。

特に、確定申告で多額の医療費控除や寄付金控除を申請した場合や、経費計上が不自然な場合は調査対象となることがあります。

また、会社からの源泉徴収だけでなく、個人で申告が必要な所得がある場合は、正確な申告と証拠書類の保管が重要です。以下のケースがある方は注意が必要です。

• 副業・不動産収入がある場合
• 多額の控除申請
• 経費計上の不自然さ

税務調査への準備と適切な対応

税理士への依頼がおすすめの理由

税務調査において税理士を依頼することで、専門的な知識や経験を活かした適切な対応が可能となります。

税理士は調査官とのやり取りや、必要書類の準備、調査時の立ち会いなどをサポートしてくれるため、精神的な負担も軽減されます。

また、税法の解釈や過去の判例に基づいたアドバイスを受けることで、無用なトラブルや追徴課税を防ぐことができます。特に、調査内容が複雑な場合や、過去の申告に不安がある場合は、税理士への依頼を強くおすすめします。

税理士の依頼で以下のような対応がスムーズに行えます。

• 専門知識によるサポート
• 調査官との交渉
• 精神的負担の軽減
• トラブル防止

必要書類と事前準備の流れ

税務調査に備えて、帳簿や領収書、請求書、契約書、通帳のコピーなど、過去数年分の書類を整理・保管しておくことが重要です。

調査通知が届いたら、税理士と相談しながら必要書類をリストアップし、不備がないか確認しましょう。また、調査対象期間の売上・経費の内訳や、取引先とのやり取りが分かる資料も用意しておくと安心です。

以下のような項目の事前準備を徹底することで、調査当日の対応がスムーズになります。

• 帳簿・領収書・請求書の整理
• 通帳コピーの保管
• 契約書・取引記録の準備
• 税理士との事前打ち合わせ

面談時の注意事項と質問例

税務調査の面談時は、落ち着いて事実を正確に伝えることが大切です。調査官からの質問には、曖昧な返答を避け、分からない場合は「確認して後日回答します」と伝えましょう。

また、調査官が求める資料は速やかに提出し、必要以上の情報提供は控えることもポイントです。税理士が同席している場合は、専門的な質問には税理士に任せると安心です。

そういった意味でも税理士への依頼は税務調査をスムーズに進めるために一つの要素となります。

税務調査の流れと実施手続き

実地調査の期間と流れの詳細

任意調査における実地調査の期間は、通常1日から3日程度で終了することが最も一般的です。小規模な個人事業主の調査は1日で完結することも珍しくありません。

ただし、取引が複雑な大企業や大規模な不正が疑われる場合は、数週間から数ヶ月に及ぶこともあります。

初日は調査官が会社や自宅を訪問し、帳簿や書類の確認、ヒアリングを実施します。

調査期間中は、追加資料の提出や質問への対応が求められることもあります。調査が長引く場合は、数回に分けて実施されることもあります。

調査終了後は、調査結果の説明や指摘事項の通知が行われます。

1. 初日に帳簿・書類の確認やヒアリング：調査官が会社や自宅を訪問し、帳簿や書類の確認、ヒアリングを実施する 。
2. 調査期間中：追加資料の提出や質問への対応が求められる 。長引く場合は、数回に分けて実施されることもある 。
3. 調査終了後：調査結果の説明や指摘事項の通知が行われる 。

調査結果の発表とその対応

税務調査の結果は、調査終了後に「指摘事項」として説明されます。

指摘内容に納得できない場合は、税理士と相談しながら再度説明を求めたり、異議申し立てを行うことも可能です。指摘事項に基づき修正申告や追徴課税が必要な場合は、速やかに対応しましょう。

修正申告の必要性と手続き

税務調査で申告漏れや誤りが指摘された場合、修正申告が必要となります。修正申告は、税務署に訂正した申告書を提出し、不足分の税金や加算税を納付する手続きです。

自主的に修正申告を行うことで、加算税が軽減される場合もあります。税理士と相談しながら、正確かつ迅速に手続きを進めることをおすすめします。

税務調査後の対策とグッドプラクティス

調査後の加算税とは？

税務調査の結果、申告漏れや過少申告が判明した場合には、追加で納税するだけでなく「加算税」が課されることがあります。加算税には、過少申告加算税・無申告加算税・重加算税などがあり、状況によって税率が異なります。

自主的に修正申告を行った場合は加算税が軽減されることもありますが、悪質な場合は重加算税が課されるため注意が必要です。

加算税の種類	税率
過少申告加算税	10～15%
無申告加算税	15～20%
重加算税	35～40%

調査内容の記録と保管方法

税務調査後は、調査官から受けた指摘事項や提出した資料、修正申告の内容などをしっかり記録・保管しておくことが重要です。

以下に記載の記録は、今後の税務調査や申告時の参考資料となり、同じミスを繰り返さないための備えにもなります。

帳簿や領収書、調査時のやり取りメモなどは、最低でも7年間は保管しておきましょう。デジタルデータでの保存も認められているため、スキャンやクラウド保存も活用すると便利です。

• 調査指摘事項の記録
• 提出資料・修正申告書の保管
• 帳簿・領収書は7年間保存
• デジタル保存も活用

今後の節税対策と業務改善

税務調査をきっかけに、日々の経理業務や節税対策を見直すことが大切です。定期的な帳簿チェックや、経費の適正な計上、税理士との相談を習慣化することで、将来の調査リスクを減らすことができるでしょう。

また、業務フローの見直しや、会計ソフトの導入も業務効率化とミス防止に役立ちます。その他、最新の税制改正や業界動向にも注意し、適切な節税策を取り入れることが重要です。

税務調査に関する最新傾向と対策

税務調査の最新動向と統計

近年の税務調査は、AIやデータ分析技術の導入により、効率的かつ的確に対象が選定される傾向が強まっています。国税庁の統計によると、調査件数は減少傾向にあるものの、1件あたりの指摘額や追徴税額は増加しています。

特に、電子取引や海外資産に関する調査が強化されているため、デジタルデータの管理や国際取引の透明性が求められます。

時期ごとの調査傾向の変化

税務調査の時期は、従来の秋（9～11月）や春（4～5月）に加え、年間を通じて分散傾向にあります。

特に、確定申告後や人事異動後の時期は調査が集中しやすいですが、AIによる自動選定の普及で、従来の傾向にとらわれない調査も増えています。そのため、どの時期でも調査に備えた準備が必要です。

税務署の方針変更と対応策

税務署は近年、電子帳簿保存法やインボイス制度など、デジタル化への対応を重視しています。これに伴い、電子データの保存や適切な記録管理が求められるようになりました。

また、海外取引や仮想通貨取引など新たな分野への調査も強化されています。最新の法改正や税務署の方針を把握し、必要な対応策を講じることが重要です。

税務調査はいつ来るのかまとめ

税務調査は誰にでも起こりうるものですが、安心して税務調査を受けるために、日頃から正確な帳簿管理と適切な申告を心がけていれば、過度に恐れる必要はありません。

税理士などの専門家と連携し、調査が来ても冷静に対応できる体制を整えておくことが大切です。不安な点は早めに相談し、安心して調査を受けられるよう準備しましょう。

執筆者プロフィール

北村 嘉章

所属：四国税理士会丸亀支部 税理士登録番号137832
肩書：
北村嘉章税理士事務所　代表税理士
合同会社 N village consulting 代表社員
穴吹カレッジ「香川県留学生支援会」　監事
家族：妻と長女と長男の4人家族
職歴：日亜化学工業株式会社(青色発光ダイオード)特許部
大手税理士法人である税理士法人ゆびすいで税理士登録
税理士業界での経験年数は10年

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